由苏门答腊岛、加里曼丹岛、爪哇岛、菲律宾群岛等2万多个岛屿组成，主要的岛屿有印度尼西亚的大巽他群岛、小巽他群岛、摩鹿加、伊里安，菲律宾的吕宋、棉兰老、米沙鄢群岛等等。
马来群岛岛屿分属于印度尼西亚、菲律宾、马来西亚。文莱和巴布亚新几内亚等国，其中包括印度尼西亚13600多个岛屿和菲律宾约7100个岛屿。
马来群岛称东南亚岛屿区，也叫南洋群岛，是世界上面积最大的群岛。它位于亚洲东南部太平洋与印度洋之间辽阔的海域上，沿赤道延伸6100公里，南北最大宽度3500公里，总面积约243万平方公里，约占世界岛屿面积的20％。马来群岛位于三大板块交界处，根据板块的运动方向，马来群岛中的菲律宾群岛及其外侧海沟是太平洋板块与亚欧板块相撞形成的，马来群岛中的大巽他群岛和努沙登加拉群岛及其外侧的深海沟则是印度洋板块和亚欧板块相撞形成的。